Jika kita mengamati situasi dalam masyarakat Indonesia, maka kita menemukan bahwa budaya kekerasan masih merajalela di mana-mana. Di sini kekerasan dipercayai sebagai satu cara, metode, bahkan gaya hidup untuk menyelesaikan konflik. Berhadapan dengan kenyataan semacam ini, maka dibutuhkan satu upaya tandingan yang bertujuan untuk menumbuhkembangkan budaya perdamaian.
Program Magister ini mempunyai tiga fokus, yaitu (1) Perdamaian yang komprehensif, yang meliputi dimensi spiritual, moral, material dan relasional, (2) Transformasi konflik yang memberi perhatian pada resolusi masalah, rekonsiliasi antar individu dan/ atau kelompok masyarakat, serta reformasi sistem dan/ atau nilai yang menghambat terjadinya perdamaian, (3) Konteks masyarakat Indonesia yang majemuk.
Program MDiv dirancang bagi lulusan S-1 non Teologi yang ingin studi teologi secara akademik dan sekaligus mendapatkan pelatihan profesional sebagai persiapan untuk menjadi pendeta. Gelar MDiv diberikan kepada mahasiswa yang telah menyelesaikan 96 sks pascasarjana, termasuk 6 sks tesis dan 6 sks praktik kejemaatan. Waktu yang dibutuhkan untuk menyelesaikan program ini adalah 3 tahun full time.
Peminat yang mendapat rekomendasi dari gereja dapat diterima dalam program ini. Peminat diharapkan memperhatikan proses seleksi sinode gerejanya dalam memilih kader-kadernya untuk studi kependetaan. Apabila kualitas seleksinya dipandang memadai, peminat yang lolos seleksi sinode akan langsung diterima di program ini.
Pendaftaran mahasiswa baru program MDiv dibuka sepanjang tahun, tetapi awal studi adalah bulan Agustus. Berkas pendaftaran yang masuk hingga 14 April akan dipertimbangkan dalam seleksi admisi gelombang pertama, sedangkan yang masuk sesudahnya dalam gelombang kedua.
Program MTh UKDW telah dibuka sejak tahun 1991. Program ini menitikberatkan pada peningkatan wawasan teologis mahasiswa, sehingga mampu berteologi secara kontekstual dan mandiri. Tujuan program MTh adalah membangun teologi Kristen Indonesia yang ekumenis, injili dan kontekstual, berakar pada berita Alkitab, terbuka untuk berdialog dengan tradisi-tradisi agama lain, sensitif terhadap persoalan-persoalan aktual yang dihadapi gereja dan masyarakat Indonesia, serta tanggap terhadap kesempatan maupun tantangan dalam globalisasi di abad ke 21 ini. Tema besar “Teologi dalam Konteks Indonesia” dijabarkan dalam sebuah kurikulum dengan 5 konsentrasi, yaitu studi Alkitab, teologi publik, teologi gereja, sejarah gereja dan studi agama-agama.
Penerimaan mahasiswa baru diadakan pada setiap semester, yaitu pada bulan Januari dan Agustus. Program MTh dapat diambil secara part time maupun full time. Gelar MTh diberikan kepada mahasiswa yang telah menyelesaikan 45 sks termasuk 9 sks tesis.
Program MMin diadakan berdasarkan kebutuhan yang dirasakan para pendeta dan pelayan lembaga Kristiani lainnya untuk memperdalam dan menyegarkan pelayanannya. MMin merupakan program profesional lanjutan yang menitikberatkan pada refleksi dan keterampilan untuk peningkatan inovasi pelayanan. Program ini dapat diambil sebagai program terminal maupun sebagai persiapan untuk mengikuti program DMin.
Gelar MMin dapat diraih setelah Anda menyelesaikan sedikitnya 12 modul. Anda tidak perlu mengambil cuti studi yang terlalu panjang. Sebaliknya, Anda harus tetap berada di tempat pelayanan dalam rangka melakukan tugas lapangan. Perkuliahan di kampus hanya membutuhkan waktu 2 x 2 minggu setiap semesternya.
Selama kerja lapangan, Anda dapat berkonsultasi dengan para dosen dan koordinator program melalui e-mail, surat, fax, telpon atau langsung datang ke kampus. Diskusi antar peserta dan dengan para dosen juga dapat dilakukan melalui milis. Untuk memenuhi kebutuhan gereja-gereja di Jawa Timur, maka mulai tahun 2005, program ini diselenggarakan dalam kelas ekstensi bertempat di GKI Emaus, Jalan Argopuro, Surabaya.
Pendaftaran program ini terbuka sepanjang tahun. Studi dimulai pada bulan Oktober atau April. Mahasiswa full time dapat menyelesaikan seluruh persyaratan dalam waktu 4 semester. Program ini juga dapat diambil secara Part time (2 modul setiap semester, diselesaikan dalam 6 semester).